本次会议的主题为"疾控机构能力建设"，陈竺要求要不失时机地推动疾控能力建设。他强调，人才队伍建设是基础。各级疾控中心都要针对性地培训出一批核心骨干，能尽快在不断增加的业务工作中发挥重要作用。要用几年的时间，集中力量和资源，对全国各级疾控机构相当数量的骨干进行系统、规范培训。同时，疾控工作要抓住我国公共卫生事业大发展的有利时机，找准定位；将疾病预防控制工作做为社区卫生、新型农村合作医疗的重要组成部分和内容。此外，还要加强能力建设的保障，下大力气，推进疾控体系建设。
陈竺还充分肯定了近年来全国疾病预防控制工作取得的巨大进展。一是应对突发公共卫生事件，尤其是对传染病的控制和应对能力有了明显的提升，各级疾控机构初步形成了密切合作的工作机制；二是我国传染病与突发公共卫生事件的信息网络直报平台建设，以及信息收集、加工、处理、传输的能力得到了极大的提高；三是重大疾病，包括传染病和慢性非传染性疾病的防控工作有了很大的进展；四是公共卫生监测与服务工作的能力有了一定的提高，在营养与食品安全、环境与健康、地方病防治、放射卫生、妇幼卫生保健以及农村改水改厕等方面都出现了可喜的进展。
